Hepatit C behandlas med två typer av läkemedel i kombination: ett immunstimulerande medel och ett virushämmande medel. Det immunstimulerande medlet är ett äggviteämne som ges som en injektion en gång i veckan. I början av behandlingen får man lära sig att injicera läkemedlet själv hemma. Det virushämmande medlet ges i form av kapslar eller tabletter som tas varje dag morgon och kväll. Under behandlingen har man regelbunden kontakt med sin sjuksköterska och läkare.
Behandlingstiden varierar beroende på genotyp och virusmängd. Genotyp 2 och 3 svarar bäst på behandling, och behandlingen pågår vanligen mellan 12 och 24 veckor. För genotyp 1 och 4 - som svarar sämre på behandling - varierar behandlingstiden mellan 24 och 48 veckor.
Under behandlingen mäts vid olika tidpunkter mängden kvarvarande virus i blodet. Ju tidigare i behandlingen man blir virusfri, desto större är chansen att läka ut sin infektion. I de fall virusmängden inte minskar tillräckligt mycket väljer man ofta att avbryta behandlingen i förtid, eftersom man vet att sannolikheten att infektionen läker ut då är mycket liten.
Sannolikheten att infektionen läker ut är ungefär 80-90% vid genotyp 2 och 3 och 40-50% vid genotyp 1 och 4. Med utläkt infektion menas att man vid blodprovskontroll 24 veckor efter avslutad behandling är fortsatt virusfri.